(1) përzgjedhja e pajisjeve. Ekzistojnë disa probleme në përzgjedhjen e pajisjeve farmaceutike, të tilla si përzgjedhja sipas përvojës (pa llogaritje aktuale ose llogaritje të pamjaftueshme të të dhënave), ndjekja e verbër e përparimit dhe hetimi i pamjaftueshëm i të dhënave fizike, të cilat ndikojnë seriozisht në praktikueshmërinë dhe ekonominë e pajisjeve.

(2) instalimi dhe trajnimi i pajisjeve. Në procesin e instalimit të pajisjeve farmaceutike, shpesh i kushtohet vëmendje progresit të ndërtimit, duke injoruar cilësinë e ndërtimit, gjë që çon në rritjen e kostove të mirëmbajtjes së pajisjeve në periudhën e mëvonshme. Përveç kësaj, trajnimi i pamjaftueshëm për personelin e mirëmbajtjes dhe operimit të pajisjeve gjithashtu paraqet rreziqe për menaxhimin dhe mirëmbajtjen e pajisjeve farmaceutike.

(3) investime të pamjaftueshme në menaxhimin dhe mirëmbajtjen e informatizimit. Në ditët e sotme, megjithëse shumë ndërmarrje i kushtojnë rëndësi të madhe menaxhimit dhe mirëmbajtjes së pajisjeve, si dhe menaxhimit të të dhënave të mirëmbajtjes së pajisjeve dhe regjistrimit të parametrave bazë dhe disa prej tyre janë bërë, disa probleme ende ekzistojnë, siç është vështirësia për të siguruar të dhëna të vazhdueshme të mirëmbajtjes, mungesa e informacionit efektiv të specifikimeve të pajisjeve farmaceutike, siç janë specifikimet, vizatimet, etj., kjo e padukshme rrit vështirësinë e menaxhimit, mirëmbajtjes dhe rindërtimit të pajisjeve.

(4) sistemi i menaxhimit. Mungesa e një sistemi dhe metodash efektive të menaxhimit, duke rezultuar në menaxhimin e pamjaftueshëm të personelit të mirëmbajtjes së pajisjeve farmaceutike, mungesën e standardizimit në punën e personelit të mirëmbajtjes, duke lënë rreziqe të fshehura për sigurinë në procesin e menaxhimit dhe mirëmbajtjes së pajisjeve farmaceutike.